根據消毒的目的可將其分為預防性消毒、臨時消毒和終末消毒。
消毒是指通過物理、化學或生物學的手段殺滅或清除環境中病原體的技術和措施。消毒是傳染病預防措施中的重要內容，它可將養殖場、交通工具和各種被污染物體中病原微生物的數量減少到最低或無害的程度。通過消毒能夠殺滅環境中的病原體，切斷傳播途徑，防止傳染病的傳播和蔓延。
物理消毒法機械性清掃、洗刷和通風換氣；干燥以及日光、紫外線和微波照射；高溫滅菌通過熱力學作用導致病原微生物中的蛋白質和核酸變性，最終引起病原體失去生物學活性而死亡的過程。
化學消毒法在疫病防治過程中，常常利用各種化學消毒劑對病原微生物污染的場所、物品等進行清洗、浸泡、噴灑、熏蒸，以達到殺滅病原體的目的。這些消毒劑對病原微生物具有廣泛的殺傷作用，但有些也可破壞宿主的組織細胞，因此通常僅用于環境的消毒。
生物消毒法是指通過堆積發酵、沉淀池發酵、沼氣池發酵等產熱或產酸，以殺滅糞便、污水、垃圾及墊草等內部病原體的方法。
在發酵過程中，由于糞便、污物等內部微生物產生的熱量可使溫度上升達70℃以上，經過一段時間后便可殺死病毒、病原菌、寄生蟲卵等病原體，從而達到消毒的目的；同時由于發酵過程還可改善糞便的肥效，所以生物熱消毒在各地的應用非常廣泛。
物理消毒法機械性清掃、洗刷和通風換氣；干燥以及日光、紫外線和微波照射；高溫滅菌通過熱力學作用導致病原微生物中的蛋白質和核酸變性，最終引起病原體失去生物學活性而死亡的過程。化學消毒法在疫病防治過程中，常常利用各種化學消毒劑對病原微生物污染的場所、物品等進行清洗、浸泡、噴灑、熏蒸，以達到殺滅病原體的目的。這些消毒劑對病原微生物具有廣泛的殺傷作用，但有些也可破壞宿主的組織細胞，因此通常僅用于環境的消毒。生物消毒法是指通過堆積發酵、沉淀池發酵、沼氣池發酵等產熱或產酸，以殺滅糞便、污水、垃圾及墊草等內部病原體的方法。在發酵過程中，由于糞便、污物等內部微生物產生的熱量可使溫度上升達70℃以上，經過一段時間后便可殺死病毒、病原菌、寄生蟲卵等病原體，從而達到消毒的目的；同時由于發酵過程還可改善糞便的肥效，所以生物熱消毒在各地的應用非常廣泛。
